历史背景
明代中期，北有瓦剌，东有倭寇；宦官专权，民不聊生。万历皇帝登基不久，朝堂之上格局变动。宦官政权和清流势力明争暗斗，此消彼长。这争斗也延续到了江湖之中黑白两道的争斗之中。武林白道人士内抗宦官专政，外御入侵之敌。黑道人士则与宦官阉党狼狈为奸，与白道人士为敌。
江湖背景
一百年前，缺德道人（宦官一派）暗中创立葵花派。葵花派，专门为缺德道人和东厂收集江湖情报，掌握江湖局势。内里人数众多，高手云集，在江湖上却声名不显；大概在同一时期，缺德道人绘出剑谱秘籍，并令当时衡山脚下一青年莫太冲无意中得之。莫太冲习练剑谱，武功大成，占山为王，创建衡山派。缺德道人暗中向衡山派输送人脉，暗中控制。衡山派实力壮大，其弟子行走江湖，亦多侠义之举。衡山派由此声名彰显，跻身五岳剑派之中。葵花派与衡山派一暗一明，一邪一正，正是缺德道人控制江湖的棋子。
朝堂之内，六扇门（警察组织）和清流学士一直与宦官势力斗争，数十年来倒也一直处于均衡状态。直到老皇帝重病，朝堂变动，缺德道人派出弟子公孙乌龙刺杀辅政大臣齐大学士，齐大学士一死，清流势力顿时处于无首状态，阵脚大乱；老皇帝死后，宦官曹公公扶持新帝上位，把持朝政，对六扇门展开了一次大清洗。六扇门元气大伤，人才凋零，郭巨侠寻求与其他江湖势力联合。
与此同时，江湖之中却是另外一番情况。缺德道人弟子白三娘，本是六扇门捕快出身，潜入葵花派卧底数十年，深知葵花派与衡山派实际都受缺德道人控制。趁缺德道人闭关修炼之际，白三娘联合郭巨侠，借助衡山内应，联合衡山掌门莫小宝，一举铲除衡山派中缺德道人的势力。而衡山派正派势力也损失惨重，掌门莫小宝更是成为这次内部斗争的牺牲品；而后数年，白三娘暗中挑唆、离间葵花派四大长老，引发四大长老内讧，厮杀而亡，其下弟子也作鸟兽散，祝无双流落江湖。
缺德道人出关，恍然惊觉白三娘卧底身份，然自己数十年辛苦经营已半付流水，惊怒交加，遂派公孙乌龙前往刺杀白三娘，同时打击与六扇门联合的江湖势力。在郭巨侠密谋与少林、武当联合之际，公孙乌龙杀死少林方丈智清大师及武当掌门冲虚道长，少林武当与六扇门之盟即破。又杀死郭巨侠请来的外援铜锣湾海龟道人，灭其徒众，给予郭巨侠沉重打击。同时，缺德道人拉拢华山掌门岳松涛，打击五岳剑派中异己势力，并指示岳松涛将五岳掌门让至莫小贝，一为掩人耳目，二则方便掌控。缺德道人反击得手，江湖又以半入其手中。
郭巨侠不甘示弱，联合了江湖上实力雄厚的开封展家、西安凌家，又寻求与锦衣卫合作。公孙乌龙找遍大半江湖，终于在同福客栈与白三娘狭路相逢，一番争斗后，死在了智商的硬伤上。这一战，郭巨侠联合了江湖两大家族，缺德道人则失去了得力助手，此消彼长，白道势力扳回一城。
然而缺德道人依然掌握着五岳剑派。莫小贝作为衡山派掌门、五岳盟主，又是不世出的学武奇才，衡山派灭门的真相就如定时炸弹一般在同福客栈之中。江湖争逐，鹿死谁手，仍未可知。
现代背景
现代社会科技已经高度发达，时空旅行已经日常化。因而在武林外传的世界中，经常会发现现代游客。
遗留下的痕迹，久而久之，当时的人们也就不以为意了。偶然也会出现因为技术故障而遗留在武侠世界的现代人士，他们有些找到了回去的途径，有些则留在这个时代生活。
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