众所周知，《口袋妖怪GO》并不是一个单人游戏，在你到达五级可以去道馆挑战的时候，你需要从三个阵营中选择一个，你占领的道馆也将以你的所在阵营的颜色表示。这三个阵营分别是 Team Mystic(神秘团队)、Team Valor(英勇团队) 、 Team Instinct(天才团队) ，对应蓝色、红色、黄色，在进入道馆后博士会给你介绍他的助手，他们分别是这三个阵营的领导。你将代表你选择的阵营占领道馆。一旦阵营确定，就不能更改。这就是为什么在你决定阵营之前要想清楚的，先来看看这几个阵营的介绍吧。
TEAM INSTINCT(天才团队)
Spark 是这个阵营的首领，这是一个相信直觉的队伍，就好像队伍名称一样，如果你相信自己的天赋，认为在战斗中的胜利归因于你的直觉，那么你不妨考虑这一阵营。这个阵营的吉祥物是传说中的 Zapdos 闪电鸟。
TEAM MYSTIC(神秘团队)
这个阵营的领导是 Blanche ，一个非常有头脑的人。蓝队最关注的就是进化，此外，这个阵营的成员不惧威胁。如果你对宝可梦背后的科学感兴趣，而且确信保持冷静是成功的关键，那么这个队伍就是你不错的选择。这个阵营的代表是急冻鸟。
TEAM VALOR(英勇团队)
Candela 是这个阵营的首领，她是一个非常有勇气的人，就像队伍名称一样。她认为要成为的一个出色的训练家，就必须为此好好锻炼。如果你善于发掘你的宝可梦的优势，并且喜欢加深与它们的联系，那么这个阵营是个不错的选择。要是你喜欢 fire bird 火烈鸟，那么也是加进这个阵营的一个不错的理由。
初代三圣鸟，分别代表三个阵营。实际上这三个阵营只是做一个区分作用，本质上没有任何的区别，玩家只要选择自己喜欢的颜色或者图腾就可以了，但在这里小编要多嘴一句，就目前的形式来看，红与蓝两个阵营明显比黄色的天才团队要多人。如何选择，就看玩家自己了。
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