在《太极熊猫》之中，如果玩家角色等级达到15级时就能够开启组队副本的进入，在历练之中就能点击并开启组队副本。在目前的组队副本游戏里面是一共有5个组队副本，分别是【兽血沸腾】、【亡魂之夜】、【剑之极意】、【绝对零度】、【勾魂索魄】，据悉在后面的版本中将会有更多的副本加入进来。
【击球双子猩猩】
【兽血沸腾】副本中，BOSS为黄猩猩和黑猩猩两只怪，他们共享血量，玩家们亲切地称他们为熊大和熊二。熊大会不断向它自己的目标翻滚，击倒路径上的玩家和武神。熊二会一系列近战输出技能，不但能造成多段严重的AOE伤害，也会造成短暂的击退，击倒等控制效果。熊二锤地会触发熊大的空翻技能，这回造成一次极大范围的AOE伤害。持续数次团队将崩溃。比较理想的策略是，将两个BOSS拉开，最好的敏捷型的宝藏猎人勾引熊大，带着他绕圈，其他众人拉开熊二，当BOSS破防时，可以再会合以增加对其中一个的输出量！如此反复，果断可以将熊大和熊二踩在脚下。
【白骨大帝】
【亡魂之夜】副本是玩家21级才可进入的副本，当然最好还是到25级再进入，以免战力不够被BOSS碾压。BOSS为单人模式中的白骨大帝，不过要后期才能见到。团队模式与剧情模式的白骨大帝玩法上略有不同。玩家在与白骨大帝的战斗过程中，场景中央会间隔出现一个不断涨大的灵魂球，灵魂球存在期间会由小变大三次，即会破散并生成出另一个白骨大帝。这个白骨大帝虽虽然相比主体弱化不少，但还是会给玩家带来不少麻烦。
玩家在进攻白骨大帝时，需要时刻注意灵魂球的动向，一旦发现灵魂球的出现，需要其中一个玩家利用仇恨拖住白骨大帝，另外两个队友尽快的击杀灵魂球，避免新的白骨大帝的出生。白骨大帝的另外一个能力是攻击吸取。攻击过程中，白骨大帝会持续吸取一名玩家的攻击力，并使得自己的攻击力不断增强，最强能达到200%的攻击力，使得输出变得极为暴力。但当白骨大帝吸取攻击力的时候，会有一条链接着白骨大帝和目标玩家的连线，并在目标玩家的头顶上以感叹号标志。此时处于被吸取攻击力的玩家尽快的与白骨大帝拉开距离，即可把连线拉断，阻止白骨大帝吸取攻击。
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